Installation et configuration d'un cluster linux

Le document ci-dessous concerne un cluster Rocks

Documentation rocks 5.4.3

http://www.rocksclusters.org/roll-documentation/base/5.4.3

Notes

1. Il faut d'abord télécharger les disques d'installation http://www.rocksclusters.org/wordpress/?page_id=80

• Il faut télécharger minimalement:

  1. Kernel/Boot Roll
  2. Core Roll
  3. OS Roll - disk1
  4. OS Roll - disk2

• Puis obtionnellement:

  1. OS Roll - disk3
  2. OS Roll - disk4
  3. OS Roll - disk5
  4. OS Roll - disk6 [not required]

• Nous avons utilisé la version 5.1

1. Installer Rocks sur le frontend et les compute nodes en suivant cette procédure: http://www.rocksclusters.org/roll-documentation/base/5.1/getting-started.html
2. Exporter les répertoires sur NFS pour tous les noeuds http://www.rocksclusters.org/roll-documentation/base/5.1/faq-configuration.html#EXPORT
3. synchroniser les comptes usagers sur les noeuds (à refaire après avoir ajouté un usager)

Faire su nom_usager

entrer la passphrase et le compte sera transfere sur /home/nom_usager Pour les compute, il est possible qu'il soit necessaire de se logger au moins une fois sur un noeud via ssh? A vérifier!

Utilisation du cluster

1. Manuel du Sun Grid Engine http://docs.sun.com/app/docs/doc/817-6117?q=N1GE
2. Pour utiliser bash http://wiki.gridengine.info/wiki/index.php/Simple-Job-Array-Howto
3. Commande utilisée par JD

Exemple de code de lancement